MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium populi BJ001 plasmid pMPOP02

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010721	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010721	CGGA	2	8	1841	1848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010721	CTC	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010721	GAA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010721	CGA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010721	GCA	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010721	CGG	2	6	1975	1980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010721	CTC	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_010721	CG	3	6	2042	2047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010721	CGC	2	6	2070	2075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010721	CGGG	2	8	2114	2121	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010721	CGG	2	6	2138	2143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010721	GCA	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010721	CG	3	6	2275	2280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_010721	GTG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010721	CGA	2	6	2334	2339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010721	GCCG	2	8	2363	2370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010721	CCGG	2	8	2442	2449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010721	ACA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010721	ATC	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010721	ACG	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010721	GAG	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010721	TCG	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010721	GAG	2	6	2765	2770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010721	GC	3	6	2786	2791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010721	CAC	2	6	2845	2850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010721	CGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010721	CGA	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010721	CGG	2	6	2893	2898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010721	TGC	2	6	2907	2912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010721	GC	4	8	2941	2948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010721	CGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010721	TCG	2	6	3060	3065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010721	TCG	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010721	GCC	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010721	TCG	2	6	3213	3218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010721	CGG	2	6	3235	3240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010721	GGT	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010721	TGCT	2	8	3349	3356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010721	GC	3	6	3370	3375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010721	CGG	2	6	3382	3387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010721	CGAA	2	8	3408	3415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010721	GC	3	6	6822	6827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010721	CA	3	6	6986	6991	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010721	GGA	2	6	7073	7078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010721	CGA	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010721	GTG	2	6	7140	7145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010721	CG	3	6	7216	7221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010721	GC	3	6	7247	7252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010721	CG	4	8	7352	7359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010721	CGG	2	6	7378	7383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010721	GCC	2	6	7940	7945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_010721	CAC	2	6	7953	7958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_010721	GGC	2	6	7960	7965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010721	TTTC	2	8	9139	9146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010721	CACG	2	8	9279	9286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010721	CTC	2	6	9292	9297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_010721	GC	3	6	9348	9353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010721	TCAT	2	8	9908	9915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010721	GCGCA	2	10	9934	9943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010721	ATG	2	6	9984	9989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010721	GGTGC	2	10	14432	14441	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010721	AGA	2	6	14464	14469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010721	GGC	2	6	14483	14488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010721	GCA	2	6	14524	14529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010721	GA	3	6	14602	14607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010721	CCT	2	6	14658	14663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010721	ACGG	2	8	14682	14689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010721	CCG	2	6	14693	14698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010721	CGA	2	6	14722	14727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010721	GCAC	2	8	14759	14766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010721	A	6	6	15604	15609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010721	CG	3	6	15696	15701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010721	TTG	2	6	15714	15719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010721	TCT	2	6	15761	15766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010721	TTC	2	6	15784	15789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010721	GGC	2	6	15846	15851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010721	TTC	2	6	15865	15870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010721	GTC	2	6	15874	15879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010721	A	6	6	15885	15890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010721	TTC	2	6	15931	15936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010721	GCA	2	6	16006	16011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010721	TTTTTG	2	12	16023	16034	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010721	GA	3	6	16054	16059	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010721	A	6	6	16072	16077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010721	CT	3	6	16092	16097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_010721	TTAC	2	8	17202	17209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010721	A	6	6	17292	17297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010721	TA	3	6	17298	17303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010721	ACAA	2	8	19665	19672	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010721	CGC	2	6	20837	20842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010721	TCG	2	6	20865	20870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010721	ATC	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010721	CGA	2	6	21371	21376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010721	GATCAC	2	12	21380	21391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010721	GAC	2	6	21396	21401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010721	TCAG	2	8	23280	23287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010721	G	7	7	23302	23308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010721	CGG	2	6	23341	23346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010721	CT	3	6	23352	23357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010721	TCC	2	6	23365	23370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010721	T	7	7	23380	23386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.